Der Name ist Programm und sagt (fast) alles über die Aufgaben des NLWKN: "Landesbetrieb für Wasserwirtschaft, Küsten- und Naturschutz". Der NLWKN gliedert sich in sieben Geschäftsbereiche, geleitet von sieben Geschäftsbereichsleiterinnen und -leitern, die ihren Sitz in Norden und Hannover haben:

• Geschäftsbereich Z (Zentrale Aufgaben): Franzis Kathe, Norden
• Geschäftsbereich 1 (Betrieb und Unterhaltung landeseigener Anlagen und Gewässer, Schadstoffunfallbekämpfung): Birgit Heddinga, Norden
• Geschäftsbereich 2 (Planung und Bau wasserwirtschaftlicher Anlagen und Gewässer): Rainer Carstens, Norden
• Geschäftsbereich 3 (Wasserwirtschaft und Strahlenschutz): Stephan-Robert Heinrich, Norden
• Geschäftsbereich 4 (Naturschutz): Berthold Paterak, Hannover
  
• Geschäftsbereich 5 (Zuwendungen): N.N.
• Geschäftsbereich 6 (Wasserwirtschaftliche Zulassungen): Dorothea Klein, Hannover